Aktiv bei:
FC Nöttingen (2000-2005)
Karlsruher SC (1987-1999)

UEFA-Pokal-Halbfinale 1993/1994
Michael Wittwer gehörte der Karlsruher Mannschaft an, die in der Saison 1993/1994 bis in das Halbfinale des UEFA-Pokal vordrang und schließlich nur wegen der Auswärttor-Regelung am SV Salzburg scheiterte.
Auf dem Weg dorthin schaltete man namhafte Gegner wie PSV Eindhoven (mit Hans van Breukelen, Erwin Koemann), FC Valencia (mit Predrag Mijatovic), Girondins Bordeaux (mit Bixente Lizarazu, Zinedine Zidane und Christophe Dugarry) und Boavista Porto aus. In der dritten Runde setzte man sich gegen Girondins Bordeux durch, für die ein gewisser Zinedine Zidane noch den 1:0 Siegtreffer im Hinspiel schoß. Die Franzosen wurden im Rückspiel mit 3:0 im Wildparkstadion besiegt. Auf bei dem zur Legende gewordenen 7:0 Heimsieg gegen den FC Valencia stand Michael Wittwer für die Karlsruher sicher in der Abwehrreihe.
Michael Wittwer wurde im laufenden Wettbewerb in 9 von 10 Spielen eingesetzt und erzielte das wichtige 1:1 im Viertelfinal-Hinspiel gegen Boavista Porto.